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生态学家经常在野外标记动物，监测它们的运动和活动，以更好地了解物种的行为和生活方式。Benjamin Koch是最早提出对细菌做同样事情的生态学家之一。
Koch是生态系统科学与社会中心(Ecoss)和生物科学系的助理研究教授，他带领一个生物学家和生态学家团队通过生态镜头研究抗生素抗性细菌。他们概述了使用基因组“标签”追踪细菌的新方法。越来越多的科学家正在关注这些细菌，这些细菌在人类和食用动物中使用抗生素的情况日益增加，或者用于食品消费的动物，在全世界范围内飙升。
这是一个复杂的情况，这就是为什么Koch和他的同事，包括Ecoss导演Bruce Hungate，想要对此采取不同的看法。
“我们显然需要更负责任地使用抗生素，”科赫说。“然而，限制抗生素耐药性的传播还需要了解抗生素抗性微生物在农场，环境和人群中的移动程度。”
Koch的研究将发表在8月份的“生态与环境前沿”上，将生态学原理应用于新获得的抗生素抗性细菌基因组数据。他和他的同事研究了科学文献中的现有数据以及美国农业部和疾病控制与预防中心收集的抗生素使用和抗药性数据。
有了这些数据，他们应用了通常用于更传统生态问题的概念，例如非本地物种如何侵入生态系统，以确定使抗生素抗性细菌成功在人类中定殖的条件。
他们收集的数据突出了抗生素抗性细菌用于在食用动物和人类之间移动的途径。通过应用基本的生态学原理 - 基本上以物种如何移动，繁殖，生存和相互作用的角度来看数据 - 科赫和他的同事可以帮助组织科学家们所知道的更好地监测，理解和管理抗生素抗性细菌的传播。
“对抗生素抗性细菌的传播模式和生活方式的这种非常详细的观点揭示了控制其传播的新见解，”科赫说。“将生态学理论与基因组数据相结合的方法可能会产生控制抗生素抗性的新策略。”
这项研究的下一步是获得细菌的环境因素和生物相互作用的“微生物视角”，其中包括研究整个食品生产链中的抗性细菌样本。他们还计划研究其他类型的抗生素抗性病原体的人与人之间的传播。
本研究和随后的研究旨在帮助科学家找到新的抗击抗生素抗性的方法，而不仅仅是开发更多更强的抗生素。这些替代方法可以包括实施针对特定抗生素抗性菌株或加强人类微生物组的更有效的卫生措施，以便更好地控制抗生素抗性细菌。
“融合生态学理论与抗生素耐药性日益普遍的基因组数据有可能彻底改变我们监测和管理抗生素耐药性的方式，”科赫说。“它也可能为我们提供强大的新工具，以减缓抗生素耐药性的蔓延。”
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