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肠道微生物组在体内提供许多有用的功能，但它也可以以有害的方式加速免疫系统。例如，当圣路易斯华盛顿大学医学院的Thad Stappenbeck及其同事去寻找一种遗传易受炎症影响的小鼠模型中的结肠炎罪魁祸首时，他们发现了Bacteroides thetaiotaomicron(B. theta))-A正常和平细菌由于某种原因在这些小鼠中引起免疫反应的物种。
Stappenbeck和体外试验中使用的同事找出哪些B. THETA抗原与CD4 + T细胞上的受体强相互作用，和工程化的小鼠模型中，只有具有T细胞与该抗原的受体。然后研究小组利用该模型研究了已知改变其基因表达以分解不同可用食物的B.theta是否会产生或多或少的关键抗原，这取决于其能量来源 - 以及这是否反过来影响T细胞反应。
当小鼠饮用葡萄糖加标水时，B.theta产生的T细胞相互作用抗原显着减少，激活产生细胞因子的T细胞减少，这可以在结肠及其淋巴结中引发免疫反应。
Stappenbeck说，这是朝着更好地了解哪些肠道微生物和抗原是炎症性肠病等炎症反应的主要罪魁祸首迈出的一步 - 也许，如何通过饮食调节这些破坏性相互作用。“这将是未来的发展方向，但我认为这将是非常了不起的事情。”
研究加州大学圣地亚哥分校宿主和共生微生物之间相互作用的Hiutung Chu表示，这是研究抗原特异性T细胞如何应对肠道微生物的首批研究之一。她说，作者“做了很好的工作，将饮食如何影响微生物组和粘膜免疫反应，但重要的是，以机械方式。”
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