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专访 | 张泽民:单细胞测序+生物信息学,“左膀右臂”助力肿瘤免疫研究

专访 | 张泽民:单细胞测序+生物信息学,“左膀右臂”助力肿瘤免疫研究

近年来,张泽民教授团队更多地利用单细胞测序技术来研究肿瘤内部微环境的异质性,以及从更细微的层面进行探索,包括细胞之间的成分、来源、相互作用机制。【详细】

2019-06-18 14:25:35 127

生物医学工程研究人员的发现和方法是游戏改变者

生物医学工程研究人员的发现和方法是游戏改变者

VCU生物医学工程系的三位研究人员进行的一项研究增强了对细胞对周围环境机械线索反应的理解,这是细胞功能的关键调节因子。助理教授Seth Weinberg,博士,学生Devin Mair和副教授Christopher Lemmon博士的“细胞 - 基质界面的机械转导动力学”采用计算实验方法,对进一步深入了解机械相互作用有深远意义。细胞。这项研究是由美国国立卫生研究院提供的180万美元资助项目的一部分,该研究发表在2017年5月的“生物物理学报&rdqu【详细】

2019-06-17 09:03:06 218

研究人员阐明了原核生物中超分子运动的动力学

研究人员阐明了原核生物中超分子运动的动力学

IV型菌毛(T4P)是引人注目的超分子机器,可驱动原核生物中的抽搐运动,蛋白质分泌和DNA摄取。T4P菌毛作为抓钩,通过延伸,表面附着和回缩的循环引起细菌抽搐运动,使细胞通过沿着它自己拉动而在表面上移动。T4P作为马达的特性先前已经过生物物理技术的审查,但T4P激活动力学对各种环境信号的调节机制仍不清楚,主要是因为许多组件协调协调动力学,并且因为T4P非常薄(直径约8nm)因此难以观察。在最近发表在“美国国家科学院院刊”上的一项研究中,东京学习院大学的生物物理学【详细】

2019-06-16 14:06:44 236

由潮汐和生物钟相互作用调节的新证据动物行为

由潮汐和生物钟相互作用调节的新证据动物行为

生活在奥克兰Piha海滩沙滩上的一种类似于板岩的甲壳类动物提供了新的证据,表明动物具有受潮汐影响的生物钟以及昼夜循环后更熟悉的生物钟,并且调节人类行为。虽然人体中生物钟的分子机制是众所周知的,包括其在人脑中的位置和所涉及的基因,但其他生物钟的机制却不是。众所周知,许多动物都有“额外的”生物钟,可根据潮汐或月球周期调节摄食或繁殖,但科学家们不确定它们是如何工作的,特别是在较长时间内。 来自奥克兰大学医学与健康科学学院的高级讲师James Cheeseman和来自奥【详细】

2019-06-15 14:47:14 96

藻类生物燃料研究的突破报道

藻类生物燃料研究的突破报道

埃克森美孚公司和合成基因组学公司今天宣布在先进生物燃料的联合研究方面取得突破,该研究涉及改变藻类菌株,使其含油量增加一倍以上,而不显着抑制菌株的生长。埃克森美孚合成基因组学研究小组利用合成基因组学的先进细胞工程技术改造了一种藻类菌株,将藻类的含油量从20%提高到40%以上。这项研究的结果发表在同行评审期刊Nature Biotechnology上,由合成基因组学的主要作者Imad Ajjawi和Eric Moellering发表。 Synthetic Genomics位于La Joll【详细】

2019-06-15 14:47:13 202

肠道微生物占据了我们脑部的份额

肠道微生物占据了我们脑部的份额

吞咽药物可以使内脏-大脑轴发生倾斜,减轻帕金森等神经退行性疾病的症状。然而,轴可以抵抗倾斜,好像它的方向是由隐藏的惯性源保持的。可疑的惯性阻尼器包括肠道微生物。尽管人们认为肠道微生物会代谢左旋多巴(治疗帕金森病的主要药物),并降低其疗效,但相关物种却没有被发现。然而,哈佛大学的科学家最近发现了一种这样的物种。科学家们梳理了来自人类微生物组项目的数据,重点研究了粪肠球菌。这种细菌吸收左旋多巴,它拥有一种酶,可以将左旋多巴转化为多巴胺。更重要的是,E. faecalis还有一个伙伴,Egg【详细】

2019-06-15 14:12:17 162

新方法可以确定肠道微生物组的来源

新方法可以确定肠道微生物组的来源

由加州大学洛杉矶分校的研究人员领导的一个小组表示,它已经开发出一种更快,更准确的方法来确定生活在人类和人类身上的许多细菌的来源。科学家们指出,从广义上讲,该工具可以推断出任何微生物组的起源。据报道,与需要数天或数周的工具相比,新的计算工具“FEAST”可以在短短几个小时内分析大量的遗传信息。该软件程序可用于医疗保健,公共卫生,环境研究和农业,根据自然方法在线发表的研究(“FEAST:微生物源追踪的快速期望最大化”)。 “分析微【详细】

2019-06-14 08:48:03 161

新研究发现食物反应受肠道微生物群的影响

新研究发现食物反应受肠道微生物群的影响

本周发表的一项研究表明,我们的肠道(肠道微生物组)中的细菌与我们所吃的食物之间的相互作用在个体之间显着不同。肠道微生物组响应的高度个性化特征表明,优化我们的微生物组的饮食干预可能需要根据个人的特定微生物组个别定制。人们早就知道我们的微生物组的健康和多样性会影响我们的健康。因此,有相当多的研究调查饮食对我们体内细菌的影响。令人惊讶的是,横断面研究报告说,不同食物对细菌种群的影响差别不大。 最新研究调查了人类肠道微生物组组成相对于个体受试者膳食摄入量的每日变化。34名受试者中的每一名都记录【详细】

2019-06-14 08:48:01 88

速览|美国费城会成为下一个生物产业中心枢纽吗?

速览|美国费城会成为下一个生物产业中心枢纽吗?

2019年6月2日-5日,由美国全球生物技术创新组织主办的一年一度的国际生物技术大会暨展览会在美国费城展举办。【详细】

2019-06-13 11:05:31 118

对人类皮肤微生物组的研究发现与年龄相关的古菌丰富

对人类皮肤微生物组的研究发现与年龄相关的古菌丰富

事实证明,你的皮肤正在爬行单细胞微生物 - 它们不仅仅是细菌。美国能源部劳伦斯伯克利国家实验室(伯克利实验室)和格拉茨医科大学的一项研究发现,皮肤微生物组还含有古细菌,一种极度喜爱的微生物,其数量随年龄而变化。研究人员对从1至75岁的人类志愿者采集的样本进行了遗传和化学分析。他们发现古生物(发音为ar-KEY-uh)在12岁以下和60岁以上的受试者中最为丰富。他们的研究表明已发表在科学报告的一篇题为“人类年龄和皮肤生理学形态多样性和皮肤古细菌丰度”的文章中。 &【详细】

2019-06-13 09:39:12 183

生物组的变化可能意味着早期发现结肠直肠癌

微生物组的变化可能意味着早期发现结肠直肠癌

肠道内有一群生物,称为肠道微生物组,与人类健康和疾病有关。最近的研究表明,评估粪便样本中的遗传变化可以准确反映肠道微生物组的状态,并可能对疾病的早期诊断有用。大阪大学的一组研究人员最近报告了特定微生物组生物的增加,这些生物与结肠直肠癌相关的恶性肿瘤有关,如粘膜内癌和息肉样腺瘤。最近发表在“自然医学快报”上的研究结果显示,这些特异性标记可以帮助区分结直肠癌和健康样本。“我们认为,结直肠癌不仅是一种遗传性疾病,也是一种微生物疾病,”该研究的一位作者Sh【详细】

2019-06-13 09:04:57 107

Berkeley Lights和Amyris合作改进微生物菌株的检测

Berkeley Lights和Amyris合作改进微生物菌株的检测

Berkeley Lights,Inc。(BLI)是数字细胞生物学领域的领导者,Amyris,Inc。是健康与保健,清洁美容,香精香料市场可持续成分开发和生产的领导者,今天宣布他们已经开始合作,致力于改善Amyris微生物菌株的高价值小分子天然产品的生产。这是BLI用于合成生物学中微生物菌株的Beacon®平台的首次应用。合作的目标是实施Beacon平台,以识别和分离产生最高量非治疗产品的微生物菌株。Beacon平台目前用于通过将先前分散的宏观流体工作流转换为自动纳米流体工作流【详细】

2019-06-13 08:59:11 111

用饮食操纵微生物组比预期更复杂

用饮食操纵微生物组比预期更复杂

根据明尼苏达大学研究人员今天在Cell Host&Microbe上发表的一篇论文,我们吃的东西与我们的肠道微生物发生的事情之间的相关性可能并不像我们想象的那么简单。此外,营养标签上看起来相同的食物对我们的微生物组有着截然不同的影响。在这项研究中,调查人员要求34名参与者记录他们吃了17天的所有食物。每天收集粪便样品,并进行鸟枪宏基因组测序。这使研究人员能够以非常高的分辨率看到不同人的微生物组以及它们所影响的酶和代谢功能如何随着它们所吃的而每天都在变化。它为分析饮食变化与微生物组随时间变【详细】

2019-06-13 08:59:10 166

用于研究生物燃料原料的全基因组测序水稻突变体资源

用于研究生物燃料原料的全基因组测序水稻突变体资源

水稻是世界一半以上人口的主食,也是研究高粱,柳枝稷和芒草等候选生物能源草的典范。为了优化作物的生物燃料生产,科学家们正在寻找能够控制关键性状的基因,如产量,抗病能力和水分利用效率。种群的突变植物,具有改变的一个或多个基因的每一个,是为阐明基因功能的重要工具。通过单核苷酸水平的全基因组测序,研究人员可以通过观察特定性状的获得或丧失来推断基因的功能。但现有水稻突变体集合的效用受到若干因素的限制,包括品种相对较长的6个月生命周期和大多数突变体系缺乏序列信息。 在植物细胞发表的一篇论文中,由P【详细】

2019-06-12 14:43:06 187

皮肤微生物的多样性可能因巴西青蛙的森林类型和栖息地而异

皮肤微生物的多样性可能因巴西青蛙的森林类型和栖息地而异

根据2017年7月5日在巴西圣保罗大学Ananda Brito de Assis的开放获取期刊“PLOS ONE”上发表的一项研究,巴西大西洋森林中蛙类皮肤微生物的多样性可能因栖息地而异。同事。皮肤细菌可以帮助保护两栖动物:一些产生抑制病原体的抗菌化合物。青蛙皮肤上的微生物成分可以反映环境,并且环境条件 - 包括太阳辐射和温度状况 - 在连续和碎片森林之间是不同的。为了观察森林类型是否影响青蛙的皮肤细菌,Assis及其同事收集了巴西连续和破碎的大西洋森林中4种蛙【详细】

2019-06-12 14:43:05 81

Nature Medicine文章解读丨从样本制备到数据分析,解读ctDNA研究的“一站式”分析体系

Nature Medicine文章解读丨从样本制备到数据分析,解读ctDNA研究的“一站式”分析体系

来自英国国家癌症中心、曼彻斯特大学、AstraZeneca等机构的研究者在Nature Medicine期刊上发表了TARGET项目第一期的研究结果,对以不同类型晚期癌症患者的ctDNA代替肿瘤组织,帮助早期临床试验进行患者选择的可行性进行了评估。【详细】

2019-06-11 22:03:17 217

研究发现噬菌体可以对肠道微生物组的动态产生深远的影响

研究发现噬菌体可以对肠道微生物组的动态产生深远的影响

肠道微生物组是一个复杂的,相互关联的物种生态系统。而且,像任何生态系统一样,有些生物是捕食者,有些是猎物。由布里格姆妇女医院和Wyss研究所的研究人员领导的一项新研究调查了噬菌体,即感染和杀死细菌的病毒的影响。他们发现噬菌体可以对肠道微生物组的动态产生深远的影响,不仅直接影响某些物种,而且还会对其他物种产生连锁效应。噬菌体也可能通过调节代谢物(包括大脑中发现的化学物质)来影响其人体宿主。该团队包括第一作者Bryan Hsu博士和Wyss研究所的共同对应资深作者Pamela Silver【详细】

2019-06-11 09:14:34 105

七种方法大比拼!Broad研究所发布单细胞RNA测序方法比较研究

七种方法大比拼!Broad研究所发布单细胞RNA测序方法比较研究

近日,来自Broad研究所的团队对7种单细胞RNA测序方法进行了比较,并希望以此为其他研究人员提供指南,并作为衡量新技术的标准。该评估将有助于Broad研究所为单细胞RNA-seq研究选择技术。此外,由于研究人员使用的均为常用的样本类型,并且开发了一种适用于所有方法的生物信息学流程,因此可以直接对新技术或现有技术的升级版进行评测。【详细】

2019-06-10 18:13:35 172

AJHG | 中南大学湘雅医院沈璐教授、唐北沙教授课题组发现人类特异GGC异常重复与神经元核内包涵体病相关

AJHG | 中南大学湘雅医院沈璐教授、唐北沙教授课题组发现人类特异GGC异常重复与神经元核内包涵体病相关

Cell出版社旗下的遗传学领域权威期刊《美国人类遗传学杂志》以论著(Article)形式在线发表了中南大学湘雅医院沈璐教授、唐北沙教授课题组的最新研究成果。该研究在国际上首次揭示了神经元核内包涵体病致病机制与NOTCH2NLC基因中GGC异常重复扩增相关。【详细】

2019-06-10 11:17:54 229
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