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生物学家发现神秘的comammox微生物

微生物学家发现神秘的comammox微生物

硝化作用在地球的自然氮循环和农业中起着关键作用。现在,维也纳大学的微生物学家Holger Daims和Michael Wagner领导的国际科学家团队发现了自己完全硝化的微生物:这一结果与教科书知识和微生物学的里程碑形成鲜明对比。该研究目前发表在Nature杂志上。氮是生命中的关键化学元素,是所有生物体的必需营养素。特别是,现代集约化农业完全依赖于氮肥。然而,用氮化合物施肥有其缺点。通过硝化作用化学转化后,肥料中的氮最终会进入地下水,河流和湖泊,并扰乱这些水域的生态平衡。来自家庭和工业【详细】

2019-02-14 08:53:01 83

使用metaBAT改善微生物基因组分组

使用metaBAT改善微生物基因组分组

DOE JGI研究人员开发了一种名为MetaBAT的自动化工具,可自动对从宏基因组序列组装的大型基因组片段进行分组,以重建单个微生物基因组。从大型复杂宏基因组数据集中准确有效地重建个体微生物基因组的能力使研究人员能够了解它们各自如何相互作用并影响全球周期。MetaBAT等工具使研究人员能够更好地了解高通量宏基因组测序产生的数据,这使得研究人员无需培养微生物群落即可对其进行研究。如果几克土壤可以容纳多种微生物相互作用以影响全球碳循环,那么想象一下,牛的瘤胃中有多少微生物有助于分解植物质量【详细】

2019-02-14 08:36:41 116

现在是揭开地球微生物群秘密的时候了

现在是揭开地球微生物群秘密的时候了

被称为微生物组的微生物群落在我们的生活中起着关键作用,但我们对它们知之甚少。来自50个机构的48名生物学家和物理科学家正致力于改变这种状况。在10月30日出版的“ 科学 ”杂志上,他们呼吁进行一项雄心勃勃的研究工作,以了解和利用微生物组。这种研究可以带来各种领域的进步,如医学,儿童发展,农业生产力和气候模型。现在,在一次广泛的圆桌讨论中,该论文的三位共同作者向卡夫利基金会解释为什么现在是时候开展一项重大的国家努力 - 统一微生物组倡议 - 研究这个星球上最不了解【详细】

2019-02-13 15:23:31 87

首先看一下美国印第安人社区的肠道微生物

首先看一下美国印第安人社区的肠道微生物

人们越来越认识到,生活在人体内和身体上的数万亿微生物 - 统称为微生物组 - 在健康和疾病中起着关键作用。然而,人们对这些微生物的多样性如何在不同人群中的差异以及这些变异是否以及如何发挥公认的健康差异知之甚少。现在,12月3日发表在“ 当代生物学 ”杂志上的研究人员已经迈出了一步,用美国原住民社区中个人肠道微生物组的首次描述填补这些空白。“来自大都市地区的欧美裔人提供了我们今天所拥有的人类微生物组的大部分信息,”俄克拉荷马大学的塞西尔刘易【详细】

2019-02-13 15:11:01 86

科学家们发现了微生物群落基因组中令人惊讶的差异

科学家们发现了微生物群落基因组中令人惊讶的差异

微小的微生物隐藏着大秘密。科学家经常使用微生物的集合或群落来研究分子功能,但社区越复杂,就越难以梳理出功能和相互作用。现在,太平洋西北国家实验室的科学家们已经进入了两个蓝绿藻微生物群落,为每个社区的所有20名成员收集近乎完整的基因组信息。这些被称为单细菌菌群(UCC)的社区是迄今为止详细描述其基因组的最复杂的群落。正如最近在应用和环境微生物学领域报道的那样,研究人员做出了两个惊人的发现,这些发现将帮助科学家更好地了解社区的功能和相互作用。 一方面,社区组成比典型分析估计的更多样化。PN【详细】

2019-02-13 14:37:02 94

新型杀灭开关 防止转基因微生物造成严重破坏

新型杀灭开关 防止转基因微生物造成严重破坏

来自麻省理工学院和哈佛大学的研究人员组成的团队已经提出了两种新的方法来将杀戮开关硬连接到转基因微生物中,以防止它变成流氓。在他们发表在“ 自然 - 化学生物学 ”杂志上的论文中,该团队描述了他们的技术,为什么他们认为它比其他方法更好,以及它的使用方式。科幻小说作家梦想着疯狂的科学家创造微生物的想法,这些微生物以某种方式进入世界并在现代科学家真正做到这一点之前很久就杀死了所有人 - 但现在技术确实存在并且随之而来的是担心这样做好东西,如用于创建治疗细菌性疾病,研究【详细】

2019-02-13 14:30:00 86

专访思路迪诊断CTO陈才夫:打造世界级肿瘤精准诊断产品,推动肿瘤诊疗一体化

专访思路迪诊断CTO陈才夫:打造世界级肿瘤精准诊断产品,推动肿瘤诊疗一体化

近日,测序中国邀请到思路迪诊断首席技术官陈才夫博士接受专访。【详细】

2019-02-13 07:45:33 97

对于僵尸微生物来说 深海自助餐是遥不可及的

对于僵尸微生物来说 深海自助餐是遥不可及的

远远低于海底,沉积物中充满了奇怪的僵尸般的微生物。虽然它们在技术上是活的,但是它们以慢动作生长,并且可能需要几十年的时间才能使单个细胞分裂 - 这是它们表面上的堂兄在几分钟之内完成的事情。伍兹霍尔海洋研究所(WHOI)的一项新研究开始通过检查它们的“食物”来源 - 附近的有机碳分子来分辨它们如何存活。该研究有助于进一步了解地球上生命的局限性,并有助于了解生命在其他星球上的存在。在1月21日出版的“自然地球科学”杂志上发表的一篇论文中,WHOI科学家【详细】

2019-02-12 16:20:47 43

土壤为天然产物提供了新的微生物来源

土壤为天然产物提供了新的微生物来源

土壤作为新的,有用的天然产物的宝库的作用再次通过发现Lysobacter细菌中尚未知的基因得到证实。Wageningen UR和NIOO进行的研究表明,这些基因或基因簇可能编码目前未知的抗菌物质。已知赖氨酸杆菌具有抗土壤真菌Rhizoctonia的疾病抑制特性。这种真菌在许多作物中引起根腐病,例如土豆,甜菜,蔬菜和球茎。然而,到目前为止,关于溶菌细菌如何发​​挥作用知之甚少。因此,来自Wageningen UR和荷兰生态研究所(NIOO)的研究人员绘制出了各种Lysobacter物种的【详细】

2019-02-12 09:46:27 106

赛伯乐携手苏州高新区共建创新中心 培育独角兽

赛伯乐携手苏州高新区共建创新中心 培育独角兽

5月24日,在苏州高新区重大科技创新项目集中签约仪式上,赛伯乐与苏州高新区进行赛伯乐工业互联网苏州创新中心项目签约。江苏省委常委、苏州市委书记周乃翔,苏州市委常委、常务副市长王翔,苏州市委常委、秘书长黄爱军,江苏省产业技术研究院执行院长刘庆,赛伯乐董事长朱敏,赛伯乐共创事业部常务副总周敏,赛伯乐苏州区域合伙人张君丽,赛伯乐南京区域合伙人彭勇出席签约仪式。苏州副市长、高新区党工委书记徐美健主持签约仪式。赛伯乐创新网络苏州合伙人张君丽和苏州高新区副主任陶冠红代表双方签约签约仪式前,江苏省委常委、苏州【详细】

2019-02-11 16:31:33 86

研究人员发现了压力和不健康的微生物组之间的联系

研究人员发现了压力和不健康的微生物组之间的联系

根据圭尔夫大学领导的一项新研究,生活在低压力环境中的红松鼠拥有更健康的微生物群落,这可能对人类健康产生影响。研究人员测试了松鼠微生物组并分析了动物的压力荷尔蒙。他们的研究发表在生物学快报上。微生物群是生活在所有生物(包括人)身体内和身体上的微生物群落。微生物组在口腔,肠道和皮肤上发现,由有益和潜在有害细菌组成,不断变化,可影响宿主的健康。“多样化的微生物组通常对您的健康有益 - 这就是人们服用益生菌的原因,”首席研究员Mason Stothart说,他是综合生物【详细】

2019-02-11 09:16:37 143

环状RNA有望成为癌症生物标志物

环状RNA有望成为癌症生物标志物

随着新技术允许研究人员深入研究基因组和外显子组,一类称为环状RNA的新RNA可能起到一个有趣的作用。 密歇根大学罗杰尔癌症中心的研究人员对多种癌症中的环状RNA进行了编目,并进行了初步研究,表明这些稳定的结构可以作为血液或尿液中的癌症生物标志物。环状RNA是一种非编码RNA,其形成闭合的环状结构而不是线性结构。新的RNA测序方法使这些方法变得清晰,对它们起作用的原因或方式知之甚少。但它们的稳定结构使其成为开发癌症生物标志物的理想候选者。 该研究发表在Cell上,确定了癌症中circRN【详细】

2019-02-10 14:37:44 85

植物如何与土壤中的有益微生物相互作用

植物如何与土壤中的有益微生物相互作用

科学家们多年来一直在想,大豆等豆类是如何根据其自身细胞对这些细菌产生友好和独特的细菌,以及寄主植物如蛋白质找到细菌并利用营养意外收获。现在,由马萨诸塞州阿默斯特大学的Dong Wang领导的分子生物学家团队与苜蓿 - 苜蓿Medic藜苜蓿一起研究,发现宿主植物中的基因如何编码识别共生细菌周围细胞膜的蛋白质,然后指导其他蛋白质来收获营养。详细信息出现在1月份的Nature Plants网站上。正如Wang解释的那样,植物通常会招募微生物以帮助它们满足其营养需求,提供光合作用的产品作为奖励【详细】

2019-02-01 10:46:48 118

改变木材的结构改变了植物微生物

改变木材的结构改变了植物微生物组

修改杨木的结构也可以改变内生微生物组,即树组织内的细菌。这是由UHasselt,UGent和VIB的研究产生的。“这是对植物木材结构有针对性的修饰对微生物组的影响的第一次深入研究之一”,Bram Beckers博士和环境科学中心的Jaco Vangronsveld教授(CMK / UHasselt)解释道。该结果最近发表在着名的科学期刊“美利坚合众国国家科学院院刊”上。用于本研究的杨树是VIB在Wout Boerjan教授(VIB / U【详细】

2019-02-01 10:35:36 71

生物学家发现了蛋白质生物合成机制的一个新方面

生物学家发现了蛋白质生物合成机制的一个新方面

我们在DNA中编码的遗传信息的很大一部分在活细胞中表达为蛋白质。为了合成蛋白质,需要将该信息从核苷酸序列转换为氨基酸的语言。解码的过程称为翻译,它涉及不同的核酸分子,信使RNA(mRNA) - 信息的“临时载体”,它是一个特定基因的拷贝。特殊的分子机器 - 核糖体 - 沿mRNA移动并读取核苷酸三联体。每个三联体编码特定的氨基酸。mRNA核苷酸简单地彼此跟随是具有挑战性的,并且核糖体必须确定开始阅读的地方。如果错误地选择要解码的第一个三联体,则核糖体开始合成错误【详细】

2019-02-01 09:20:01 101

研究表明 感染海洋微生物的病毒丰度存在很大差异

研究表明 感染海洋微生物的病毒丰度存在很大差异

病毒比人类或植物感染更多。对于海洋中的微生物 - 包括那些每天捕获大气中一半碳的微生物 - 病毒是一种主要威胁。但是,将于2016年1月25日发表在“ 自然微生物学 ”杂志上的一篇论文表明,这些病毒群体的大小远不如科学家们长期认为的那样确定。研究人员收集并重新审查了过去25年记录的超过5,600个海洋微生物细胞和病毒种群的估计数,研究人员发现病毒种群在不同地点之间以及海洋深度不同的情况下变化很大。该研究强调了控制气候模型和其他生物地球化学措施的另一个不确定因素。【详细】

2019-01-31 15:40:07 111

舌微生物组可以帮助识别早期胰腺癌患者

舌微生物组可以帮助识别早期胰腺癌患者

根据发表在口腔微生物学杂志上的一项新研究的结果,生活在舌头上的某些细菌丰度的差异可以将早期胰腺癌患者与健康个体区分开来。虽然已经在其他身体组织的胰腺癌患者中发现了对微生物组的破坏 - 生活在我们身体内和身体上的微生物群体 - 但这是舌苔中细菌变化的第一个证据。如果在更大规模的研究中得到证实,这可能为这种高度侵袭性疾病开发新的拯救生命的早期发现或预防工具铺平了道路。英国每年有近10,000人被诊断患有胰腺癌,其中不到1%的人存活超过10年。早期诊断可以大大提高成功治疗的机会 - 但这对这种疾病提出【详细】

2019-01-31 15:37:50 51

在微生物群落中发现的高度组织的结构

在微生物群落中发现的高度组织的结构

细菌通常生活在混合群落中,存在许多不同种类的细菌。但是,这些社区的组织方式在很大程度上是未知的,因为没有技术可以看到它们在太空中的结构。本周,科学家们首次描述了生活在牙菌斑中的不同细菌组合,他们使用一种新的成像方法发现了这种方法,该方法“切断了微生物群落中极其复杂的细节,并允许常见的模式通过。” 该研究发表在美国国家科学院院刊上,由伍兹霍尔海洋生物实验室(MBL)的Jessica Mark Welch和剑桥Forsyth研究所的Gary Borisy领导。研究小【详细】

2019-01-31 15:36:55 138

植物生物传感器可以帮助非洲农民抗寄生虫'巫术'

植物生物传感器可以帮助非洲农民抗寄生虫'巫术'

多伦多大学的工程和生物学教授制定了一项新战略,帮助非洲农民对抗破坏农作物的寄生植物。Striga属植物,也称为巫婆,作为其他植物的寄生虫,攻击其根系并为其自身目的劫持它们。虽然他们的紫色花很漂亮,但充满了斯特里加植物的田地实际上是一个想要种植玉米,高粱,水稻或其他自给作物的农民的噩梦。这个问题影响了撒哈拉以南非洲25个国家的1亿多人。U化学工程教授Alexei Savchenko和细胞与系统生物学系的Peter McCourt教授创建了一种基因工程植物生物传感器,这种工具将帮助他们寻找可以预防S【详细】

2019-01-31 15:29:53 67

从温泉中揭开隐藏的微生物谱系

从温泉中揭开隐藏的微生物谱系

尽管全球微生物种群数量几乎比地球上或地球上的任何其他种群大几个数量级,但迄今为止只发现了一小部分。美国能源部(DOE)正在寻求揭示地球微生物多样性的真实程度,以便更多地了解在调节关键生物地球化学循环中起关键作用的基因,酶和代谢途径。更彻底的调查可能会为能源部研究人员推进其能源和环境调查的新策略。在2016年1月27日发表在Nature Communications上的一项研究中,美国能源部联合基因组研究所(JEI)的研究人员领导的一个团队利用最大的宏基因组数据集来发现一个全新的细菌门。【详细】

2019-01-31 15:26:39 90

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