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揭示蛋白质相互作用网络中的新关系和组织原则

揭示蛋白质相互作用网络中的新关系和组织原则

蛋白质是细胞和组织的基本成分,通过与网络中的合作伙伴合作,可以发挥许多生物功能。这些网络的动态特性 - 蛋白质在不同时间和不同细胞环境中与不同伙伴相互作用 - 可能对研究它们的科学家提出挑战。然而,Stowers医学研究所的研究人员已经将数学方法应用于大型蛋白质组学数据集,以揭示对复杂和动态网络组织的新见解。在Nature Publishing Group的科学报告中发表的一篇新文章中,使用称为拓扑数据分析(TDA)的高级数学方法研究了酵母酿酒酵母中的两种蛋白质INO80 和人类细胞系【详细】

2019-01-02 11:03:07 157

驯化我们基因组的蛋白质

驯化我们基因组的蛋白质

EPFL的科学家们对一个庞大而神秘的人类蛋白质家族进行了基因组学和进化研究,以证明它负责利用人类基因组中数以百万计的转座因子。这项工作揭示了主要的物种特异性基因调控网络,这些网络影响着人类生物学的所有健康和疾病。在人类基因组中包含数百万从所谓的可转座元件,遗传的单位,“跳”围绕整个基因组的序列。长期以来被认为是垃圾DNA,转座因子现在被认为是影响基因的表达。然而,这一规定的程度及其如何利用迄今未知。EPFL科学家现在首次对大约350种人类蛋白质家族进行了广泛研究【详细】

2019-01-02 10:56:05 105

研究小组通过劫持蛋白质合成中涉及的两个因素 发现细菌围攻邻近细胞的新方法

研究小组通过劫持蛋白质合成中涉及的两个因素 发现细菌围攻邻近细胞的新方法

所以他们不能使用智能手机或WiFi,但是细菌已经发展出一些非常复杂的策略来相互通信。由此产生的相互作用是合作的微妙平衡,在某些情况下是竞争。这些种内交换发生在接触依赖性生长抑制(CDI)系统中,其通过细胞与细胞接触调节细胞活性,并且存在于多种革兰氏阴性细菌中,包括重要的人类病原体如大肠杆菌。加州大学圣塔芭芭拉分校生物学家的新研究探讨了一种特殊致病菌株大肠杆菌-EC869如何导致人类腹泻或出血性结肠炎 - 通过转移抑制其细胞生长的毒素来破坏其邻居。其他UCSB研究人员以前的研究表明,大肠【详细】

2019-01-02 10:14:07 119

研究表明 直到现在被认为是非编码的环状RNA可以编码蛋白质

研究表明 直到现在被认为是非编码的环状RNA可以编码蛋白质

以色列和德国的一组科学家,由耶路撒冷希伯来大学的Sebastian Kadener教授领导,发现了一种用于环状RNA的蛋白质编码功能。这种RNA分子在脑细胞中具有高活性,可在神经退行性疾病中发挥重要作用。几年前,科学家们发现了一种新型的RNA分子。与所有其他已知的RNA不同,该分子形成闭环,因此被标记为环状RNA(circRNA)。虽然circRNA分子很丰富 - 特别是在我们衰老时它们积累的大脑中 - 对它们的功能知之甚少。与由基因产生并具有制造蛋白质的信息的信使RNA(mRNA)相【详细】

2019-01-02 09:36:33 39

用于预测蛋白质结构的大数据方法

用于预测蛋白质结构的大数据方法

没有蛋白质在体内没有任何作用,它们是我们细胞中的分子全能者。如果它们不能正常工作,可能会导致严重的疾病,如阿尔茨海默氏症。为了开发修复功能失常蛋白质的方法,必须知道它们的结构。卡尔斯鲁厄理工学院(KIT)的研究人员利用大数据方法开发出一种预测蛋白质结构的方法。在美国国家科学院院刊(PNAS)中,研究人员报告说,无论实验如何,他们都通过统计分析成功地预测了最复杂的蛋白质结构。蛋白质结构的实验测定非常麻烦,不能保证成功。蛋白质是生命的基础。作为结构蛋白,它们参与组织的生长,例如指甲或毛发。【详细】

2019-01-02 09:22:14 59

隐藏在蛋白质中的蛋白质具有进化的捷径

隐藏在蛋白质中的蛋白质具有进化的捷径

澳大利亚和美国的科学家们在分子生物学和进化论发表的一项研究中将如何在向日葵中进化出类似药物的蛋白质环。尽管进化过程​​耗时约4500万年,但研究人员仍将其称为捷径。研究小组包括西澳大利亚大学的研究人员; 墨尔本拉筹伯大学,田纳西大学和德克萨斯大学。团队负责人Joshua Mylne博士是西澳大学分子科学学院的首席研究员,隶属于国家ARC植物能源生物学卓越中心。该团队使用前所未有的大量DNA序列信息来记录一个不同寻常的植物蛋白家族的进化。 。第一作者,刚刚在西澳大学完成博士学位的Acha【详细】

2019-01-02 09:15:39 56

生物学家发现蛋白质变异产生了惊人的强烈影响

生物学家发现蛋白质变异产生了惊人的强烈影响

可以清楚地区分任何两个个体的遗传物质。慕尼黑工业大学(TUM)的计算生物学家现在已经确定DNA变异的影响被大大低估了。新的见解可能会影响个性化医疗的进步。蛋白质是生命的机器。没有它们,没有细胞可以发挥作用。大约20,000种蛋白质负责人体的新陈代谢,生长和再生。蛋白质的构建块是氨基酸。根据DNA中包含的确定的蓝图将它们组装在细胞中。一项涉及60,000人血液样本的广泛研究表明,健康个体的蛋白质之间存在惊人的广泛差异。在两个非相关个体中,平均20,000个构件 - 即氨基酸 - 具有称为【详细】

2018-12-26 10:54:43 132

蛋白质如何促进细胞死亡

蛋白质如何促进细胞死亡

蒂宾根大学和康斯坦茨大学,波鸿鲁尔大学,斯图加特马克斯普朗克智能系统研究所和德国癌症研究中心的研究人员共同努力,以获得对蛋白质网络的新见解,该蛋白质网络调节细胞的程序化分解,又称细胞凋亡。这些Bcl-2蛋白很难研究,因为它们在细胞的水状细胞质和它的油状细胞膜之间交换。只有少数方法可用于分析两种环境中的蛋白质相互作用。通过特殊类型的光谱分析,该团队解码了网络中三个组件的复杂相互作用。他们的研究结果发表在最新的Nature Communications上。细胞自杀小队 “我们的【详细】

2018-12-25 10:32:22 86

控制健康和疾病中未折叠的蛋白质反应

控制健康和疾病中未折叠的蛋白质反应

筛查工具,现成的治疗方法和药物开发的潜在途径所产生的信息是知情临床研究和临床试验设计的基石。在2017年8月发行的SLAS DISCOVERY(以前的生物分子筛选杂志)的新评论中,作者Eric Chevet博士,Inserm U1242(法国雷恩)等。分析最近的文献并回顾未折叠蛋白反应(UPR)对健康和疾病的影响。除了提供针对UPR三个分支的分子的深入描述之外,该综述还提供了可用于筛选和开发新型治疗剂的工具的概述,所述治疗剂可以调节UPR以用于未来的疾病干预。 UPR响应于内质网(ER【详细】

2018-12-25 10:05:54 78

研究人员发现CRISPR蛋白质如何找到它们的靶标

研究人员发现CRISPR蛋白质如何找到它们的靶标

加利福尼亚大学伯克利分校的研究人员发现了Cas1-Cas2是一种蛋白质,它负责CRISPR免疫系统在细菌中适应新病毒感染的能力,它可以识别基因组中插入病毒DNA的位点,这样它们就可以了以后认出来并发动攻击。这些蛋白质最近用于编码细菌基因组CRISPR区域的电影,依赖于CRISPR DNA的独特灵活性将其识别为应插入病毒DNA的位点,确保先前病毒感染的 “记忆” 正确存储。该文件,这将在网上公布7月20日在科学的詹妮弗·杜德纳和她的研究小组,用电子显【详细】

2018-12-25 09:46:20 123

显微镜技术的结合揭示了关键蛋白质复合物的三维结构

显微镜技术的结合揭示了关键蛋白质复合物的三维结构

Stowers医学研究所的研究人员已经解决了复合物的三维结构,这对于在生殖细胞分裂或减数分裂过程中将染色体正确分选成卵子和精子至关重要。当这种称为联会复合体的结构在细胞中不能正常组装时,它可能导致染色体异常,流产和先天缺陷。自从联合复合体于1956年首次被发现以来,研究人员一直试图识别它的许多运动部件以及它们如何组合在一起。他们的努力受到物理定律的限制:即使是最高功率的显微镜,结构也太小而无法可视化。现在,Stowers的研究人员,包括Cori Cahoon,Zulin Yu,Ph.D【详细】

2018-12-24 10:14:41 104

发现球状蛋白质允许鱿鱼眼睛调整光线失真

发现球状蛋白质允许鱿鱼眼睛调整光线失真

(Phys.org) - 宾夕法尼亚大学的一组研究人员发现了鱿鱼眼睛能够适应水下光线失真的方法。在他们发表在“ 科学 ”杂志上的论文中,该小组描述了他们在显微镜下分析鱿鱼眼部位的工作,他们发现了什么,然后解释了鱿鱼视觉所涉及的过程。奥地利格拉茨医科大学的托比亚斯·马德尔(Tobias Madl)概述了镜片在同一期刊中的透视作品中的工作原理,并概述了这项新工作所做的工作。之前的鱿鱼工作表明他们的眼睛是独一无二的。每个透镜的折射率在其中心处最大,并且朝【详细】

2018-12-24 09:14:27 131

研究人员发现膜蛋白质的折叠机制

研究人员发现膜蛋白质的折叠机制

瓦伦西亚大学的一个国际研究小组包括证明,膜蛋白的折叠开始之前插入的生物膜,这几十年来一直是人们的生化研究中心。这项研究发表在《自然通讯,由Ismael Mingarro协调,生物化学和分子生物学教授。自膜蛋白超过一半的药物的受体是目前市场上,至关重要的是了解他们折叠以设计更有效的药物。“折叠蛋白质合成完成之前开始,这是一个伟大的发现来了解这些重要的药理目标采用功能结构,“Ismael Mingarro说。 蛋白质由氨基酸通过肽键相连,形成的生物大分子进行大部分的【详细】

2018-12-23 19:00:21 87

详细解释光合作用的蛋白质结构和功能

详细解释光合作用的蛋白质结构和功能

一个国际研究小组的研究解决了结构和阐明光合作用复杂。此膜蛋白的功能复杂的动态重组光合作用过程中起着重要作用。马克斯·普朗克生化研究所的团队,大阪大学和波鸿Ruhr-Universitat连同他们的合作伙伴在《科学》杂志上报告工作,2018年12月20日在线发表。“结果接近最后的主要差距之一在我们的理解光合作用电子运输途径,”马克Nowaczyk博士副教授说,波鸿集团项目”的负责人蓝藻膜蛋白复合体”。 生物学的电路 复杂的我发【详细】

2018-12-23 18:38:55 120

科学家发现刺激人类骨骼生长的蛋白质

科学家发现刺激人类骨骼生长的蛋白质

美国科学家发现,一种名为Jagged-1的蛋白质刺激干细胞分化为产生骨骼的细胞。该研究结果在“干细胞”杂志上发表,表明Jagged-1可以帮助人类和动物患者更快地治愈骨折,并可能成为治疗罕见代谢病症Alagille综合征的基础。 虽然人体骨骼看起来是静止和永久的,但骨组织实际上在我们的生活中形成和改变。称为成骨细胞的细胞形成骨,并且衍生自称为间充质干细胞的前体细胞,其存储在骨髓中。这些干细胞必须从身体接收特定信号才能成为成骨细胞。 之前的研究已经确定了一种叫做骨【详细】

2018-12-23 12:31:14 80

蛋白质缺陷指向新的共济失调

蛋白质缺陷指向新的共济失调

在过去的二十年中,已经鉴定了几种遗传机制用于不同类型的共济失调,即中枢神经系统和外周神经系统的神经系统疾病。这些范围从编码线粒体蛋白的基因突变到在DNA修复中起作用的突变。一组沙特阿拉伯和法国研究人员发现了一种未知形式的隐性共济失调,这是一种遗传性的共济失调,他们将三名来自一个大血缘家庭的沙特阿拉伯儿童称为“Salih共济失调”。 研究人员发现,这种形式的共济失调是由基因KIAA0226的突变引起的,该基因 编码新的蛋白质rundataxin。三个孩子的父母和单【详细】

2018-12-23 11:23:49 149

自组装蛋白质复合物可以为纳米结构提供支架

自组装蛋白质复合物可以为纳米结构提供支架

当血红蛋白仅经历一个突变时,这些蛋白质复合物彼此粘附,堆叠像乐高积木形成长而硬的细丝。这些细丝反过来延长了镰状细胞病中发现的红细胞。50多年来,这是唯一已知的教科书例子,其中突变导致这种细丝形成。根据Weizmann科学研究所结构生物学系的Emmanuel Levy博士和他的小组,Lego类组件应该在进化过程中相对频繁地形成。这种组装方法可以是常见的,还是很容易重现?他们的答案最近发表在“ 自然”杂志上,可能对生物学研究和纳米科学产生影响。血红蛋白和许多其他蛋白【详细】

2018-12-22 10:56:26 148

在锥虫线粒体中发现异常的蛋白质产生

在锥虫线粒体中发现异常的蛋白质产生

在线粒体,细胞的发电厂,有自己的蛋白质工厂,虽然电池设备可以轻松地为他们的工作。一种特殊的真核生物甚至可以快速传递蛋白质组装所需的所有转移RNA。伯尔尼大学的研究人员现已发现这种极不寻常的进口机制如何发挥作用。锥虫(小细胞生物)对研究人员特别感兴趣有两个原因。例如,锥虫会引起各种疾病,包括致命的人类昏睡病,对此仍然没有好的治疗方法。但也许更有趣的是锥虫的独特生物化学特征。了解这些生物体中基本机制的偏差可以对我们自己细胞的特征产生有价值的见解。蛋白质机械的神秘努力 事实证明,其中一个谜团【详细】

2018-12-22 10:16:29 118

细菌蛋白质作为choanoflagellates的春药

细菌蛋白质作为choanoflagellates的春药

美国研究人员在他们的实验中研究单细胞生物如何进化成多细胞偶然发现了一种奇怪的现象:单细胞真核生物称为choanoflagellates,它是与动物最亲近的亲戚,开始进行性繁殖以响应细菌产生的蛋白质。为什么这种情况在自然环境中发生仍然不清楚,尽管他们推测它可以帮助choanoflagellates容易与同一物种的其他人交配。该发现于8月31日在Cell杂志上发表。Choanoflagellates是一组原生生物,用作模型生物,用于研究动物的进化起源。加州大学伯克利分校和哈佛医学院的研究人【详细】

2018-12-22 10:00:48 78

蛋白质TAZ向干细胞发送混合信号

蛋白质TAZ向干细胞发送混合信号

正如观察者的眼中存在美,信号取决于接收者的解释。根据干细胞报告发表的新的USC研究,一种名为TAZ的蛋白质可以传递非常不同的信号 - 不仅取决于哪种干细胞,还取决于干细胞的哪一部分接受它。在品种方面,一些干细胞是“幼稚”的空白板块; 其他人被“引发”以区分成某些类型的更专业的细胞。真正天真的是小鼠 胚胎干细胞(ESCs),而引发的品种包括稍微分化的小鼠外胚层干细胞(EpiSCs)以及所谓的人类“胚胎干细胞” - 它【详细】

2018-12-22 09:28:57 95

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